ABCD-J

#RSE #Stories hinter #ABCD-J: Venkatesh (www.abcd-j.de/de/contribut...) entwickelt #case-e. Er liebt es, Probleme aus Nutzersicht zu lösen und einfache Lösungen für komplexe Herausforderungen zu finden. Inspiration liefern ihm Humor und gute TV-Serien.

Wir stellen #case-e vor, ein #OpenSource #eCRF System für die klinische Forschung: abcd-j.de/de/software/.... Es unterstützt Forschungsteams bei der Studienkonzeption, der Datenverwaltung und der Datenvalidierung und gewährleistet so konsistente, sichere und wiederverwendbare klinische Daten. #FAIR

#FunFactFriday 🔎💡 #eCRFs (Electronic Case Report Forms) ersetzen Papierformulare in klinischen Studien durch digitale Fragebögen für Teilnehmenden-, Besuchs- und Bewertungsdaten. Sie unterstützen konsistente, validierte und wiederverwendbare Daten für #FAIR Forschungsdatenmanagement #eCRF #RDM

Wie lassen sich Fragebogendaten standortübergreifend zusammenführen? #Metadaten beschreiben Fragebögen, Variablen und Studien und schaffen die Grundlage für Datenharmonisierung. Im #ABCD-J entwickeln wir dafür ein Metadaten-System, das im #TRR379 bereits im Einsatz ist: abcd-j.de/showcases/ca...

🏆 Zum Abschluss der #OHBM Konferenz in Bordeaux wurde das Poster von #ABCD-J Projektpartnern um @mih.mas.to.ap.brid.gy mit dem Publikumspreis ausgezeichnet. Das Poster stellt durch das ABCD-J Verbundvorhaben entwickelte Softwarekomponenten vor. Hier gehts direkt zum Poster: doi.org/10.5281/zeno...

🧠 Vom 14.-18. Juni fand #OHBM statt – eine der größten wissenschaftlichen Veranstaltungen im Bereich der #Neurobildgebung. Mitten drin: ABCD-J. Mit vielen motivierten Kolleg:innen vom @fz-juelich.de haben wir dem interessierten Fachpublikum die verschiedenen tools von #ABCD-J vorgestellt.

#RSE #Stories hinter #ABCD_J: Adina Wagner (www.adina-wagner.com; www.abcd-j.de/de/contribut...) ist seit vielen Jahren Teil des Entwicklungsteams um die Software #DataLad. Forschungssoftware vereint für Adina die schönsten Aspekte wissenschaftlicher Arbeit.

#ABCD-J arbeitet an vertrauenswürdigem #MachineLearning (z.B. #JuLearn) in Verbindung mit ethischer Forschung zu medizinischer #KI am @fz-juelich.de, ein Thema der Gruppe #Neuroethik und #Ethik in der KI und der Phil.Tech.Talks. Erfahren Sie mehr: abcd-j.de/de/news/2026... #ML #AI

#JTrack umfasst zwei Apps: JTrack Social & JTrack EMA+ 📱 EMA+ ist eine #OpenSource App für datenschutzfreundliche #EMA 📊 In einer Pilotstudie nutzen 179 Eltern sie bis zu 480 Tage. Bei Langzeitnutzung wurden individuelle Veränderungen sichtbar 👉 www.abcd-j.de/de/showcases... #Studienhighlights

Neues #Studienhighlight aus #ABCD-J: Mit #JTrack Social wurde Gang & Gleichgewicht per Smartphone analysiert. Die Studie zeigt, dass quantitative Bewegungsdaten mit minimalem Aufwand erfasst werden können – ein Schritt Richtung skalierbarer #mHealth! 👉 www.abcd-j.de/de/showcases...

Wie sich motorische Fähigkeiten mit dem Alter verändern und welche Rolle das Geschlecht spielt, zeigte eine Studie im Rahmen von #ABCD-J. Im aktuellen #Studienhighlights fassen wir sie zusammen. Die Studie nutzte Datensätze via fosstodon.org/@datalad. 👉 abcd-j.de/de/showcases... #Motorik #OpenData

Zum Jahresende haben sich alle Partner zu einem Netzwerktreffen am @fz-juelich.de getroffen. Es ging um die Ergebnisse von 2025, weitere Kooperationen & Synergien, und um die Zukunft: Wie kann ABCD-J nach Ende der Projektförderung nachhaltig weiterbetrieben werden? www.abcd-j.de/news/2025-ne...

Übrigens: Auf der Hauptseite von abcd-j.de läuft mittlerweile das Erklärvideo zum Projekt. Hier wird die Idee hinter dem Projekt in wenigen Minuten dargestellt. Schauen Sie gern mal rein! abcd-j.de

Zurück zu unseren Partnern: Ebenfalls Teil von #ABCD_J ist die Uniklinik Düsseldorf. Die Schwerpunkte der involvierten Institute liegen auf der Erforschung von entzündlichen Erkrankungen, Schlaf und zirkadianen Rhytmen, und sozialen Interaktionen.

Ende Oktober fand die #distribits2025 zu verteilten Datenmanagement Technologien statt - inklusive einiger Projekte, die auch wir nutzen. Wer an den wissenschaftlich-technischen Vorträgen interessiert ist, kann sie nun auf der Konferenzwebseite oder auf YouTube ansehen: fosstodon.org/@distribits/...

Die @uniklinikkoeln.bsky.social bringt Daten und Expertise zu Neurodegeneration und Schlaganfallforschung ins #ABCD-J Projekt, aber auch in der Anwendung digitaler Methoden im Bereich psychotischer und affektiver Erkrankungen.

Das B in #ABCD_J ist die Uniklinik #Bonn: abcd-j.de/sites/ubonn/. Dort ist die Klinik für Psychiatrie im Bereich der Früherkennung und Behandlung psychischer Erkrankungen wissenschaftlich aktiv, einschließlich der Nutzung eines "Virtual Reality” Labors.

Der nächste Projektpartner ist die #RWTH_Aachen. Die medizinische Fakultät sitzt am Universitätsklinikum Aachen, und ist eine der forschungsstärksten Fakultäten der Universität. Aktuell wird dort beispielsweise mit #JTrack das #FACROSS Projekt durchgeführt: www.ukaachen.de/fileadmin/fi...

Beim Garmin Health award wurde ein Projekt mit dem Jury Preis ausgezeichnet, das #JTrack und Smartwatches zur Begleitung und Überwachung von Fatigue bei Krebspatienten einsetzt. Wir freuen uns sehr und sagen herzlichen Glückwunsch! www.garmin.com/en-US/newsro...

Wer sind die #ABCD_J Projektpartner? Etwa @fz-juelich.de – eine der größten Forschungseinrichtungen Europas. Dort sitzt das INM-7, das das ABCD-J Projekt koordiniert, technische Infrastruktur stellt & #Forschungssoftware entwickelt, die die klinischen Partner verwenden: www.fz-juelich.de/inm/inm-7

Die #ABCD-J Projektpartner trafen sich am 4. Juli zu einem Jahresgespräch auf dem @dlr-de.bsky.social Projektträger-Campus in Bonn, um die Fortschritte zu besprechen und die zukünftige Ausrichtung des Projekts zu vereinbaren: www.abcd-j.de/de/news/2025.... #Kooperationsnetzwerk #OpenScience

Lesen Sie mehr auf der #ABCD_J Website: www.abcd-j.de/de/news/2025....

Danke an alle, die beim #Workshop und #Hackathon in Aachen (30.6.–2.7.) dabei waren—gemeinsam organisiert von #DKZ.2R, #WiNoDA, @nfdi4ing.bsky.social, @nfdi4objects.bsky.social! 3 Tage #DataLad und #Datenmanagement: Von der Einführung bis zur praktischen Arbeit an Anwendungsfällen der Teilnehmenden.

In den #Neurowissenschaften heißen diese Veranstaltungen auch häufig #Brainhack. Beim Brainhack auf der diesjährige Kongress der deutschen Gesellschaft für klinische Neurophysiologie und funktionelle Bildgebung #dgkn25 waren die #ABCD-J #ResearchSoftwareEngineers dabei: www.abcd-j.de/de/news/2025...

#Softwareentwicklung ist nicht etwas, das man nachts bei Kaffee und Pizza alleine macht. #Forschungssoftware ist #kollaborativ! Ein beliebtes Format zur Entwicklung und Vermittlung ist ein sogenannter #Hackathon: eine meist interdisziplinäre kurzweilige Soft- oder Hardwareentwicklungsveranstaltung.

#ABCD-J #Studienhighlights: Eine kürzlich erschienene Studie zeigt mittels #JTrack Social Unterschiede in Kommunikationsmustern zwischen neurotypischen Erwachsenen und Erwachsenen mit #Autismus-Spektrum-Störung auf. Neugierig geworden? Das ganze Highlight gibt es hier: www.abcd-j.de/de/showcases...

#RSE #Stories hinter #ABCD-J: Stephan Heunis (www.abcd-j.de/contributors...) entwickelt #datalad-catalog, die #Software hinter unserem (Meta-)Datenkatalog. Früher hat er mit Echtzeit-fMRI in Gehirne geschaut, jetzt baut er #Open-Source #Tools zur Unterstützung inklusiver Wissenschaftsgemeinschaften.

#RSE #Stories hinter #ABCD-J: Mehran Turna (www.abcd-j.de/contributors...) ist ein #JTrack #Entwickler. Neben der Forschung zu digitalen #Biomarkern und #mobileHealth arbeitet Mehran ehrenamtlich mit code.org zusammen, um Teenagern das Programmieren und die Bedienung von Robotern beizubringen 🤖

Übrigens: Wenn auch Sie mit den technischen Lösungen des #ABCD-J Projekts arbeiten wollen, gibt es keine Hindernisse: Unsere #Software steht zur freien Verfügung. Außerdem gibt es regelmäßige virtuelle #Sprechstunden zum Austausch mit Interessierten: www.fz-juelich.de/de/inm/inm-7...

#JuLearn – eine #ML #Python Bibliothek im #ABCD-J #Open-Source-Software Stack – wird als @fz-juelich.de #JuRSE (Jülich Research Software Engineering) #Code of the Month für Mai 2025 vorgestellt! Lesen Sie mehr auf der JuRSE-Website: www.fz-juelich.de/en/rse/commu.... #MachineLearning #Software #RSE

Die #JuLearn #Python Bibliothek ermöglicht es Nutzern, #ML Modelle aus #pandas DataFrames zu testen, indem sie die Menge des notwendigen Codes minimiert und Datenlecks vermeidet. Sie fördert verzerrungsfreie Methoden und Ergebnisse, die konsequent auf Verallgemeinerbarkeit getestet werden.

Gibt es eine Rolle für #AI in dem #ABCD-J Projekt? Ja! Und #JuLearn (juaml.github.io/julearn/main...) -- eine #Open-Source-Software, die auf @scikit-learn.org aufbaut -- ist die Art und Weise, wie wir sie implementieren.

Die #Software dahinter ist fosstodon.org/@datalad catalog (docs.datalad.org/projects/cat...), eine freie #Open-Source-Software zum Erstellen von (Meta-) #Datenbrowsern.

Schon gewusst? Im #ABCD-J #Datenkatalog (data.abcd-j.de) können Projektpartner Informationen über #Datensätze hinterlegen und auffindbar machen. Damit machen wir wissenschaftliche #Daten #FAIR, aber nur so weit zugänglich, das der #Datenschutz gewahrt bleibt. #RDM #Metadaten

Eine #Datenverwaltungssoftware, mit der wir arbeiten, ist fosstodon.org/@datalad (joss.theoj.org/papers/10.21...). DataLad und #gitAnnex organisieren die Veranstaltung #distribits2025. Wer sich für verteiltes Datenmanagement interessiert, ist eingeladen, fosstodon.org/@distribits zu folgen. #RDM

Hinter den Kulissen jedes Forschungsprojekts steht das #Forschungsdatenmanagement. Gerade bei klinischen Daten müssen die Daten gut nutzbar und nachvollziehbar sein und verantwortungsvoll gehandhabt werden. Wichtiger Schritt nach der Erhebung ist z.B. das #Datenmanagement nach den #FAIR-Prinzipien.

Studienteilnehmer nutzen die Apps "JTrack EMA+" und "JTrackSocial", um im Rahmen einer Studie Daten (z.B. Sensordaten, kognitive Testleistung, Fragebögen) zu erheben und zu übermitteln. Aus diesen Informationen werden digitale #Biomarker entwickelt, die klinische Entscheidungen unterstützen sollen.

Zentrales Werkzeug für #ABCD-J ist die #Open-Source-Software #JTrack, eine Plattform zur kollaborativen Erhebung von Daten via Smartphone (www.frontiersin.org/journals/pub...). Die Apps “JTrackEMA+” und “JTrackSocial” gibt es für Android und iOS. #mhealth #EMA #Datenerhebung

Die #EMA minimiert Erinnerungsverzerrungen und ermöglicht es, Veränderungen im Verhalten und in der Physiologie über die Zeit zu verfolgen. Die damit entstehende Datenbasis ergänzt Patienteninformationen, die in der Klinik erhoben werden. #ABCD-J #mhealth

Im Kontext unserer #ABCD-J Erhebungen reden wir von #EMA, ecological momentary assessments. EMA ist eine Datenerhebungsmethode, bei der Patienten nicht einmalig (z.B. im Arztgespräch) befragt werden, sondern regelmäßig und häufig in Alltagssituationen (z.B. durch die #JTrack App auf ihrem Handy).

Alle Interessierten an #digitalen #Biomarken sind im Rahmen der @fz-juelich.de "Wissenschaft Online” Vortragsreihe herzlich zu Prof. Jürgen Dukarts Vorlesung “Biomarker auf dem Weg zur Personalisierten Medizin” am 27.03. eingeladen: www.fz-juelich.de/de/ueber-uns....

Das #ABCD-J Projekt setzt auf Smartphone-basierte Erhebungen, um neue digitale Biomarker zu identifizieren, die zur #Früherkennung und #Behandlungsevaluation von neurologischen und psychiatrischen Erkrankungen eingesetzt werden können.

Was sind #digitale #Biomarker? Biomarker sind biologische Merkmale, die Hinweise auf normale oder krankhafte Prozesse geben können (z.B. Blutwerte). Digitale Biomarker sind Messwerte, die mittels Sensoren mit einem Fitnessarmband oder Smartphone erfasst werden (z.B. Herzrate oder Sprache).

Mit #ABCD-J wollen wir klinische Forscher eine digitale Infrastruktur zur Verfügung stellen, die 1) #Datenerhebung mit #mobileHealth-Technologien, 2) #Datenmanagement nach den #FAIR-Prinzipien und 3) automatisierte #Datenanalyse mit #ML-Algorithmen, mit dem Ziel, digitale #Biomarker zu entwickeln.

Die #ABCD-J-Plattform wurde durch die Expertise der Universitätskliniken in @rwth.bsky.social, @unibonn.bsky.social, @unicologne.bsky.social und @hhu.de sowie @fz-juelich.de gegründet. Erfahren Sie mehr auf unserer Website: www.abcd-j.de.

Was steckt eigentlich in einem Namen, und vor allem, woher kommt #ABCD-J? Kurz gesagt, bedeutet es "Accessing Behavior for Clinical Data and Joint Usage". Die lange Antwort ist, dass es ein kollaboratives #Netzwerk braucht, damit technische Projekte auf breiter Ebene erfolgreich sein können.

Dazu integrieren wir – das Institut für Neurowissenschaften und Medizin: Gehirn und Verhalten (INM-7) @fz-juelich.de, und unsere klinischen Partner an den Unikliniken Aachen, Bonn, Köln, und Düsseldorf – verschiedene technische Lösungen zu einer digitalen Plattform und vernetzen uns.

Hallo Bluesky! Zeit für unsere #Vorstellung. Hier postet das #ABCD-J Projekt. Wir sind eine vom Land NRW geförderte Initiative für die Verbesserung von klinischer Forschung mittels #Biomarkern und #mobileHealth.