IFB/ELIXIR-Fr
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Institut Français de Bioinformatique (IFB) et noeud français d'ELIXIR Europe IFB is the national #bioinformatics infrastructure for #lifesciences communities and the French node of @elixir-europe.org 💻 https://www.ifb-elixir.fr/
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📍 Poste basé à Saint-Martin-d'Hères (38) 💼 CDD de 12 mois Pour en savoir plus et candidater : www.ifb-elixir.fr/nous-rejoind... #Recrutement #Ingénieur #Bioinformatique #OffreEmploi #PEPR #Dynabiod
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📢 Voici le 47ème numéro des #bioinformations : bioinformations.fr 📍 Au sommaire : la communauté scientifique se mobilise, du cristal pour l' #IFB core cluster, retours sur #JOBIM2026 et bien d’autres actualités à découvrir ! 🤓 Bonne lecture, et n'hésitez pas à partager le lien sur vos réseaux.
Pour découvrir l’ensemble des nouveautés 👉 www.abromics.fr/1-6-0-the-ab... N'hésitez pas à vous inscrire, à tester et à explorer cette nouvelle version de la plateforme ABRomics et à envoyer vos commentaires à notre équipe d'assistance : analysis.abromics.fr/contactus
🧬 Le projet #ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
📢 📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru ! 🔎 Au programme : All-hands IFB ; une nouvelle collection HAL pour l’infra (🙏 @cnrs-inist.bsky.social ) ; actualités des plateformes IFB, ELIXIR France ; formations ; dernières publications IFB/ELIXIR-FR ; …
Vous souhaitez la lire et/ou vous abonner ? C’est possible depuis le site internet de l’IFB 👇 www.ifb-elixir.fr/newsletter/
👉 Des questions sur ces nouveautés ? On est disponibles pour en discuter sur Tchap ! www.ifb-elixir.fr/outils-servi... Vous trouverez aussi tous les détails de cette nouvelle version sur GitLab : gitlab.com/ifb-elixirfr...
Philippe Glaser a présenté la plateforme ABRomics puis a répondu lors d’une session de questions-réponses : “ABRomics, une plateforme omique pour la surveillance et la recherche en antibiorésistance.” Plus d’informations 👉 www.abromics.fr/abromics-pre...
🧬 Le projet ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrs.fr @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
📢 🌟 IFB/ELIXIR-FR contributed to this milestone in the HARVEST project as a member and co-coordinator of the project!
🌾 The HARVEST project, funded by ELIXIR, has made it easier to package, validate and reuse #plantresearch datasets. #FAIRification Read the news: elixir-europe.org/news/harvest denbi.bsky.social @ifb-elixir-fr.bsky.social elixiruknode.org ebi.embl.org
💡 Cette newsletter a pour objectif de diffuser encore plus largement les avancées du projet, les actualités scientifiques et de contribuer au partage des connaissances autour de cette problématique majeure. Pour découvrir ce 4e numéro et vous inscrire aux prochains : www.abromics.fr/newsletter/
📢 Du 31 Août au 04 Septembre 2026, Julie Lao (IR sur la PF ABRomics) et Claudine Médigue (co PI ABRomics) étaient à Genève pour participer à la 25e édition de la conférence Européenne annuelle de bioinformatique ECCB (eccb2026.org), organisée par le SIB (Swiss Institute of Bioinformatics).
🔎 L’ensemble des fonctionnalités de la plateforme ABRomics dans sa version génomique a été présenté dans un poster lors de la session du mercredi matin : “ABRomics: a platform for antibiotic resistance research and public health using an integrated ‘one Health’ approach”. (hal.science/hal-05732017)
🌟 Les visites ont été nombreuses, y compris pendant la pause déjeuner, ce qui témoigne de l’intérêt de la communauté pour les fonctionnalités originales offertes aujourd’hui par la PF ABRomics ! Pour en savoir plus 👉 www.abromics.fr/abromics-at-...
📢 Du 31 Août au 04 Septembre 2026, Julie Lao (IR sur la PF ABRomics) et Claudine Médigue (co PI ABRomics) étaient à Genève pour participer à la 25e édition de la conférence Européenne annuelle de bioinformatique ECCB (eccb2026.org), organisée par le SIB (Swiss Institute of Bioinformatics).
Check out this presentation by @bebatut.bsky.social , ELIXIR-France (IFB/ELIXIR-FR) co-lead for the FAIRyMAGs project! 🙏
ELIXIR’s internal project, FAIRyMAGs, is developing #FAIR Galaxy workflows 💡, benchmarking approaches and training materials for metagenome-assembled genomes. 🙌 Support reproducible analysis for researchers to apply consistent workflows. 🔗 Watch project update: https://loom.ly/NnhPL3M
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The ELIXIR-funded FAIRyMAGs project has released a set of 🙌 openly available workflows, training materials and example #datasets to support researchers working with metagenome-assembled genomes 👉 loom.ly/yh_aNFE @ifb-elixir-fr.bsky.social @ebi.embl.org @denbi.bsky.social @elixir-it.bsky.social
🙏 Thanks for including #IMGT in the @elixir-europe.org Core Data Resources, an ELIXIR France (@ifb-elixir-fr.bsky.social ) resource established and managed by the Institut de Génétique Humaine (UMR 9002 CNRS - Univ. Montpellier) and the @cnrsbiologie.bsky.social ! 👏
📣 ELIXIR has recognised #IMGT, the international immunogenetics information system, as an #ELIXIRCoreDataResource following the adoption of an open licence for its scientific data and metadata. Read the news👉 https://loom.ly/BVb-d28 @ifb-elixir-fr.bsky.social
Thank you to everyone who took part in the @elixir-europe.org FAIR metadata workshop, which was co-organised by Hervé Menager!
🙌 Thank you to all who joined ELIXIR sessions and visited our booth at #ECCB2026 this week! It was great to see the 🗣️ lively discussions and exchanges of ideas around 🎯 #biodiversity, #AI, health and #FAIRdata at the ELIXIR sessions. @sib.swiss
📣 Plus que 3 jours pour vous inscrire à la formation "Alphafold et audelà" qui se déroulera en janvier 2027 à Orsay !👇 moodle.france-bioinformatique.fr/course/view....
📢 🧬🚀 L'Institut Français de Bioinformatique, en partenariat avec l'IDRIS et les plateformes PRABI-AMSB, BIOI2 , CUBIC et Bilille, organise la seconde édition de la formation "AlphaFold et au-delà : Modélisation de la structure 3D des protéines avec des outils d'IA" du 20 au 23 janvier 2027.
Pour découvrir l’ensemble des nouveautés 👉 www.abromics.fr/1-5-0-the-ab... N'hésitez pas à vous inscrire, à tester et à explorer cette nouvelle version de la plateforme ABRomics et à envoyer vos commentaires à notre équipe d'assistance : analysis.abromics.fr/contactus
🧬 Le projet ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrs.fr @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
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📣 Vous êtes interessé.e par notre formation "Alphafold et au-delà" qui se déroulera en janvier 2027 à Orsay ? N'attendez plus et pré-inscrivez-vous avant de voguer vers l'horizon des vacances ! 🙂 👇
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