Valentin Loux

Article 15 de la Convention relative aux droits de l'enfant

Check out this presentation by @bebatut.bsky.social , ELIXIR-France (IFB/ELIXIR-FR) co-lead for the FAIRyMAGs project! 🙏

OpenCodeReview est un projet open-source sous licence Apache-2.0 permettant d’automatiser la revue de code et l’analyse de la sécurité par IA. Propose des analyses complètes à la ligne de code, règles pour NPE, thread-safety, XSS, injections SQL, ... ⬇️ github.com/alibaba/open...

« On dispose d’une fenêtre limitée » : les géants de l’IA distillent leurs conseils cyber sur une menace qu’ils connaissent bien 👉 https://l.numerama.com/wkq

#TalentsCNRS Des infrastructures de calcul haute performance pour traiter les données produites par la biologie moderne en quantités massives 💻 Présentation de l'IFB Core Cluster, #CristalCollectif du CNRS 👉 www.insb.cnrs.fr/fr/personne/... @ifb-elixir-fr.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social

Strix est un projet open-source sous licence Apache-2.0, permettant à des agents IA autonomes de réaliser des tests d’intrusion, trouver, valider et aider à corriger les vulnérabilités d’une application ⬇️ github.com/usestrix/strix

👏Nous sommes très heureux de voir l’équipe IFB-Core-Cluster être lauréate de ce cristal collectif ! Une récompense qui souligne et valorise un travail mené depuis plusieurs années pour développer et maintenir cette infrastructure numérique distribuée.

C'est dans les vieux pots qu'on fait la meilleure soupe… de vieilles techniques Bash permettent de contourner les protections de nombreux agents de développement via des attaques sur la supply chain. 👉 www.securityweek.com...

🔎👋 Rendez-vous l'année prochaine pour la prochaine édition de JOBIM à Grenoble du 06 juin au 09 juillet 2027 ! 😎

Très heureux qu'Émilie ai pu présenter Siduri et tous les travaux menés par l'équipe sur la gestion et la valorisation des données de Ferments du Futur à #JOBIM2026 👏🏻

👏 Emilie Fernandez a présenté avec brio le portail #Siduri au coeur de la gestion et exploitation des données du Grand Défi #FermentsDuFutur. Un ambitieux projet de @inrae-migale.bsky.social

💼 première session #jobfair 💼 Rencontres et discussions à @jobim2026.bsky.social 🧬🥨 #jobim #jobim2026 #jebif @sfbi.fr @ifb-elixir-fr.bsky.social @inrae-maiage.bsky.social @inrae-france.bsky.social

🚀 new bwa-mem3 is out. Why use it? - 🏛️keep using a bwa-mem variant (avoid revalidation/reprocessing) - 🚅 1.7x faster/20% less memory than bwa-mem2 - 🧬native methylation support (asymmetric scoring) - ✅ matches bwa-mem2 output - 👊opt-in knobs to go even 2x faster bwa-mem3.readthedocs.io/en/latest/

Un rappel, encore une fois, que vivre à la rue tue, et pas seulement quand il fait froid. Le nombre de morts de la rue augmente chaque année sous le regard indifférent d'une société incapable de prendre soin des plus précaires.

Au moins 929 personnes sans domicile fixe, à qui un hommage sera rendu mardi midi à Paris, sont décédées en 2025 en France, selon un décompte provisoire du collectif les Morts de la rue. ➡️ https://l.liberation.fr/3j

🏃🏃🏃 Strava Launches MCP Connector 😀 for Strava Subscribers only 😐 restricted to Claude (" looking to support other AI clients in the future ") 😠 I want to be able to use local open-source LLM ! 🏃🏃🏃 #Scientist #Geek #Running #Ultra-runner press.strava.com/articles/str...

Do you work with genetic resources collected elsewhere 🧬 ? Are you confident that you’re using them fairly and legally? New step-by-step guide to the Nagoya Protocol helps researchers navigate this complex framework. www.ebi.ac.uk/about/news/p...

For more information and to pre-register: training.galaxyproject.org/training-mat... @galaxyproject.bsky.social @galaxytraining.bsky.social

I'm thrilled to co-organize and teach at the first-ever training event focused on advanced Galaxy features: workflows, API, and more! Registration is now open until June 5, so don’t miss your chance to dive deep into these powerful tools.

Le BSI, l'autorité allemande de cybersécurité, s'inquiète de la capacité de Mythos d'Anthropic, à accélérer massivement la découverte de failles logicielles. 👉 www.latribune.fr/art...

Excited to discover that two of my software tools (Shovill & Snippy) were used to assemble the genome of the #Hantavirus Andes Chile-9717869 strain. #bioinforbioinformatics #genomics #microbiology www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MT95...

🧵 THREAD: Hantavirus on a cruise ship What we know, What investigators are doing, and Why you don't need to panic

🎊 Félicitations à Sophie Schbath, nommée #ISCB #Fellow 2026 ! 👏 Présidente de la SFBI (2011-2015), Sophie a contribué à notre communauté par son dynamisme scientifique et humain. Merci à @iscb.bsky.social pour cette distinction qui honore un membre de notre si belle communauté !

Congrats Sophie ! Well deserved , so proud for you !

A great meeting with a warm welcome from our spanish colleagues !

End-to-end evaluation of pipelines for metagenome-assembled genomes reveals hidden performance gaps https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.04.06.712906v1

La DINUM annonce le Socle Interministériel d'IA Générative, une offre mutualisée pour déployer l’IA générative dans les administrations françaises. 👉 alliance.numerique.g...

Whenever I presented Phold, I was frequently asked "can you do the same beyond phages?" We ( @oschwengers.bsky.social @linsalrob.bsky.social @binomicalabs.org et al) finally did it with Baktfold github.com/gbouras13/ba... www.biorxiv.org/content/10.6...

🧐 Baisse du nombre d'offres d'emploi (post-doctorants, ingénieurs, permanents ou temporaires) en 2025. 🫵 Besoin de vous pour comprendre les raisons de cette diminution via ce sondage : grist.numerique.gouv.fr/o/docs/forms... 📎 Bilan plus détaillé : www.sfbi.fr/blog/article...

[📢 #Workshop] Vous souhaitez en savoir plus sur la mise en conformité FAIR des données de métabarcoding ? 🗓️ Rendez-vous le 10 avril 2026 de 13h30 à 17h, pour un workshop en visio, organisé par le projet MUDIS4LS (www.ifb-elixir.fr/rd-innovatio...).

A lire, cet excellente histoire des rapports de l'État avec le logiciel libre et du projet La suite numérique : framablog.org/2026/03/19/l... merci @framasoft.org

✨ GCC2026 | Clermont-Ferrand, France 🇫🇷 The Galaxy Community Conference brings together researchers, developers, trainers, and users to share their work and ideas. 📣 Submit your abstract by April 6. galaxyproject.org/events/gcc20...

Check this out 👀 “Ten Common Misconceptions About Galaxy (And Why They Are Wrong!)” is now published in PLOS Computational Biology! The paper takes on 10 persistent myths about Galaxy and responds with evidence and real-world examples from the community. galaxyproject.org/news/2026-02...

We are pleased to announce the publication of panREPET, a pipeline that identifies TE insertions shared by groups of individuals. By Saidi, Blaison, del Pilar Rodríguez-Ordóñez, @johannconfais.bsky.social, @hquesneville.bsky.social 📖 doi.org/10.1186/s130...

🎉 Time to celebrate! The Galaxy Training Network just passed 500 tutorials! Free. Open. Community-built. Reproducible. Powered by 500+ contributors worldwide, making data analysis accessible to everyone. Be sure to check out this amazing team and the GTN, here: training.galaxyproject.org

Vous codez en R et souhaitez adopter le package #Tidyverse pour manipuler vos données de façon plus poussée ? 👉 Notre cycle de formation vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (78) 📅 30-31 mars 2026. 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous avez besoin de vous former à #Linux ? 👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas 📅 1er avril 2026 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

📌 Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s dans les instituts de recherche, universités, établissements d’enseignement et recherche, secteur associatif ou privé 📎 framaforms.org/enquete-meri... ⏳ temps estimé : 20 minutes 📅 date limite de réponse : 31/03/2026

[LAST CALL] 📢🚨✍️ École thématique d’assemblage et annotation de génomes et métagénomes, organisée par l' @ifb-elixir-fr.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social Pré-inscriptions ouvertes jusqu’au 20 février !

🚨📢📄 Article in press in Genome Biology doi.org/10.1186/s130... We introduce panREPET, a reference-free pipeline to detect shared transposable element (TE) insertions across pangenomes and retrace their evolutionary dynamics #TEsky 🧵👇

Toujours le même constat et aucune action : « Le 2 février, 6 040 personnes qui étaient parvenues à joindre le 115 ont été laissées sans solution d’hébergement, soit 10 % de plus qu’à la même date en 2024. Parmi elles, 1 793 étaient des enfants – dont 390 âgés de moins de trois ans »

📌 #JOBIM2026 - Strasbourg (jobim2026.sfbi.fr) 📝 Appel à soumission jusqu’au 15/03. Infos : premc.org/doc/JOBIM202... 🏆 Prix meilleures talk et posters. Participation à la soumission de votre résumé 🚆👶 10 bourses de voyage ; demande du 30/04 au 21/05 + bourses garde d'enfant. Infos : www.sfbi.fr

Vous utilisez déjà Galaxy et souhaitez vous familiariser avec les méthodes et outils d’analyse bioinfo de données NGS ? #mapping #assemblage 👉Notre cycle de formation vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (26 mars). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous souhaitez vous initier aux bonnes pratiques pour la reproductibilité de vos analyses ? 👉 Nous vous proposons ce module d’un jour à Jouy-en-Josas (24 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous pratiquez R et souhaitez créer votre 1e application web interactive à partir de scripts R ? #Shiny Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (23 mars 2026). 📝 Inscription et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Marie Curie, Paulette Libermann, Sophie Germain… Les noms d’éminentes scientifiques seront gravés en lettres d’or, d’ici 2027, sur la tour Eiffel. L'astrophysicienne Isabelle Vauglin : «On travaille à pas de fourmis contre l’invisibilisation des femmes»

Besoin de vous former au langage R ? Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" propose ce module introductif à Jouy-en-Josas sur 2 jours (10 et 11 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html